兩岸是否簽和平協議，陸委會主委陳明通在立法院受訪及備詢時多次指出，涉及兩岸政治性談判，必須由行鑲嵌玻璃政院提出談判計畫，立法院要2/3同意，政院在談判之前若要了解民意動向，可先諮詢性公投且不受《公投法窯燒玻璃》限制；談完之後，採現行修憲公投門檻交由全民複決。他並多次指名是國民黨主席吳敦義提出的，但因目前監督機制太弱，才會提出修法。
陳明通強調，兩岸間的政治性議題需要社會高度共識，若像前立委張慶忠那樣半分鐘通過，將會引起社會爭議，因此如果要談政治議題，應由行政院提出談判計畫，經立法院2/3同意後才可以談。在這之前，行政院可以進行全國諮詢性公投來了解國人意向，談回來的協議也要有3/4立委出席、3/4立委同意後才能公告，最後再經公投過半通過才算數。
